Mutaciones la variante Ómicron


Mutaciones la variante Ómicron

*Ilustración de las ubicaciones de las mutaciones de ómicron en la proteína de pico. Vista superior (izquierda) y vista lateral (derecha) que muestran sustituciones de aminoácidos (amarillo), eliminaciones (rojo) e inserciones (verde). En esta estructura trimérica dos monómeros (gris y azul claro) tienen sus dominios de unión al receptor en la conformación inferior mientras que uno (azul oscuro) está en la conformación superior o abierta. Datos de mutación de la OMS. Estructura de PDB : 6VYB.

La variante tiene una gran cantidad de mutaciones, algunas de las cuales son preocupantes.​ Treinta y dos de estas mutaciones afectan a la proteína espiga. Dicha espiga es el principal objetivo antigénico de los anticuerpos generados por infecciones y de la mayoría de las vacunas administradas hasta 2021. Muchas de esas mutaciones no se habían observado en otras cepas. La variante se caracteriza por 30 cambios de aminoácidos, tres pequeñas supresiones y una pequeña inserción en la proteína espiga en comparación con el virus original, de los cuales 15 están ubicados en el dominio de unión al receptor (residuos 319-541). También lleva una serie de cambios y supresiones en otras regiones genómicas. Es de destacar que la variante tiene tres mutaciones en el sitio de división de la furina.​ El sitio de escisión de la furina aumenta la infectividad del SARS-CoV-2.​ Las mutaciones por región genómica son las siguientes:

  • Proteína espiga: A67V. Δ69-70. T95I. G142D. Δ143-145. Δ211. L212I. ins214EPE. G339D. S371L. S373P. S375F. K417N. N440K. G446S. S477N. T478K. E484A. Q493R. G496S. Q498R. N501Y. Y505H. T547K. D614G. H655Y. N679K. P681H. N764K. D796Y. N856K. Q954H. N969K. L981F
  • ORF1ab:
    • nsp3: K38R. V1069I. Δ1265. L1266I. A1892T
    • nsp4: T492I
    • nsp5: P132H
    • nsp6: Δ105-107. A189V
    • nsp12: P323L
    • nsp14: I42V
  • Proteína de la envoltura: T9I
  • Proteína de membrana: D3G. Q19E. A63T
  • Proteína nucleocápside:P13L. Δ31-33. R203K. G204R

Fuente: Wikipedia

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