Mutaciones la variante Ómicron

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Mutaciones la variante Ómicron

*Ilustración de las ubicaciones de las mutaciones de ómicron en la proteína de pico. Vista superior (izquierda) y vista lateral (derecha) que muestran sustituciones de aminoácidos (amarillo), eliminaciones (rojo) e inserciones (verde). En esta estructura trimérica dos monómeros (gris y azul claro) tienen sus dominios de unión al receptor en la conformación inferior mientras que uno (azul oscuro) está en la conformación superior o abierta. Datos de mutación de la OMS. Estructura de PDB : 6VYB.

La variante tiene una gran cantidad de mutaciones, algunas de las cuales son preocupantes. Treinta y dos de estas mutaciones afectan a la proteína espiga. Dicha espiga es el principal objetivo antigénico de los anticuerpos generados por infecciones y de la mayoría de las vacunas administradas hasta 2021. Muchas de esas mutaciones no se habían observado en otras cepas. La variante se caracteriza por 30 cambios de aminoácidos, tres pequeñas supresiones y una pequeña inserción en la proteína espiga en comparación con el virus original, de los cuales 15 están ubicados en el dominio de unión al receptor (residuos 319-541). También lleva una serie de cambios y supresiones en otras regiones genómicas. Es de destacar que la variante tiene tres mutaciones en el sitio de división de la furina. El sitio de escisión de la furina aumenta la infectividad del SARS-CoV-2. Las mutaciones por región genómica son las siguientes:

Proteína espiga: A67V. Δ69-70. T95I. G142D. Δ143-145. Δ211. L212I. ins214EPE. G339D. S371L. S373P. S375F. K417N. N440K. G446S. S477N. T478K. E484A. Q493R. G496S. Q498R. N501Y. Y505H. T547K. D614G. H655Y. N679K. P681H. N764K. D796Y. N856K. Q954H. N969K. L981F
ORF1ab:
- nsp3: K38R. V1069I. Δ1265. L1266I. A1892T
- nsp4: T492I
- nsp5: P132H
- nsp6: Δ105-107. A189V
- nsp12: P323L
- nsp14: I42V

Proteína de la envoltura: T9I
Proteína de membrana: D3G. Q19E. A63T